یک ملاح ایرانی به نام سندباد در تلاش برای یافتن کتاب جادویی صلح , یک اثر مرموز است که Eris , الهه فاسد یونانی هرج و مرج , در نهایت او را برای دزدی تعیین کرده‌است ! اگر او در این جستجو موفق نشود , دوست دوران کودکی او پرنس Proteus از سیراکوز مجازات اعدام را به دست خواهد آورد در حالی که Eris جایگاه مطلوب قدرت

پنگوئن های باغ وحش مرکزی ماداگاسکار در شب کریسمس عازم یک ماجراجویی در شهر میشوند

دانشکده ی فیبر، سال 1962، «پینتو» (هالسی) و «فلوندر» (فورست) وارد گروه دلتا، ننگین ترین «گروه برادری» در دانشکده می شوند. سرپرست دانشجویان «دین و ورمر» (ورنن) در پی راهی است تا اعضای آنارشیست دلتا را اخراج کند و در این راه «گرگ مارمالارد»(دو تن) سردسته ی گروه رقیب دلتا،امگا نیز به او کمک می کند...

این انیمیشن کوتاه با محوریت شخصیت اصلی کارتون "گربه چکمه پوش" ماجرای سه بچه گربه که زاده ی گربه ی قهرمان داستان می باشند را روایت می کند و …

پس از پر شدن باتلاقش از موجودات جادویی، یک غول موافقت می کند که یک شاهزاده خانم را نجات دهد و زمین خود را پس بگیرد.

چهار حیوان که دیگر از بودن در باغ وحش خسته شده‌اند، تصمیم به فرار می گیرند و به طور ناخواسته با چهار پنگوئن همراه میشوند. بعد از گذراندن ماجراهایی، آن‌ها خود را در ماداگاسکار می یابند.

پنگوئن های ماداگاسکار مثل قبل ماموریتی را در پیش رو دارند و باید جلوی کسی را که قصد دارد دنیا را نابود کند، بگیرند.

حیوانات قصد دارند به باغ وحش نیویورک بازگردند، اما با سقوط هواپیما در طبیعت وحشی آفریقا، آن‌ها با حیواناتی از نوع خودشان آشنا میشوند، و الکس والدینش را ملاقات میکند.

چهار حیوان به نامهای «آلکس (شیر)»،«مارتی (گورخر)»،«ملمن (زرافه)» و «گلوریا (اسب آبی)» در قسمت جدید هم در تلاش هستند تا به باغ وحش نیویورک برگردند و در راه برگشت در حالی که از اروپا می گذرند برای اینکه کمتر جلب توجه کنند،‌ به یک سیرک سیار می پیوندند...